Você pode arrastar C:\Users\%USERNAME%\AppData\Local\Google\Chrome\User Data\Chrome App Launcher.lnk
para a barra de tarefas do Windows para restaurar o atalho do iniciador de aplicativos ou, melhor ainda, copiar o ícone para C:\ProgramData\Microsoft\Windows\Start Menu\Programs\Google Chrome
se tiver privilégios de administrador.