Depois de algum trabalho de pesquisa, eu acho um post em SO que pode resolver minha problema usando modelos.Espero que seja útil para vocês.
Cria modelos pythontmp.txt e phptmp.txt em alguns diretório (exemplo: ~/.vim/templates/ ) como abaixo
#!/usr/bin/env python(php)
Adicione a seguinte configuração para .vimrc
autocmd bufnewfile *.py :0r ~/.vim/templates/pythontmp.txt
autocmd bufnewfile *.php :0r ~/.vim/templates/phptmp.txt