Se você montar seu disco local dentro do LiveCD OS, o SO poderá ver o vírus, se esse vírus adotar o mecanismo de "ver" para infectar seu sistema operacional atual, para que seja possível ser infectado. No entanto, não conheço nenhum vírus que faça isso. Além disso, lembre-se de que o vírus deve estar na plataforma usada pelo seu LiveCD (Probabilly Linux). Eu acho que você estará seguro em usar o LiveCD e não terá nenhum problema com um disco host infectado.
Além disso, o único problema que pode ser infectado pelo vírus é o SO que já está carregado e rodando na sua memória RAM a partir do LiveCD (a instância atual do LiveCD), o LiveCD geralmente é somente leitura. Portanto, se você suspeitar de alguma coisa na sua instância atual do sistema operacional, reinicie o sistema operacional LiveCD e mantenha o disco local desmontado.