Claro. Na verdade, é uma maneira muito padrão de adicionar um ventilador a um sistema, com muitos ventiladores adicionais ligados diretamente a um par de conectores Molex estilo "pass-through".
O seu sistema provavelmente tem muitos conectores Molex nos mesmos trilhos para uma dada voltagem, então não importa como / onde o ventilador está conectado.
Uma pesquisa rápida no Google sugere não cientificamente que um fã usa menos de 0,5 A, e um disco rígido usa menos de 2 A. Eu suspeito que você deve obter 6-20 A em um trem de 12 V, mas você pode obter isso trivialmente da sua PSU.
Eu acho que você estaria melhor olhando para a classificação da sua fonte de alimentação (em sua própria fonte de alimentação), ventilador e HDD para decidir se é "seguro" - mas as chances são de que deveria estar inteiramente dentro das especificações.