Uma possibilidade é a pasta "WindowsApps" em Arquivos de programas, que armazena os aplicativos da UI do Metro. Como eles são executados em uma sandbox segura, há muita duplicação de arquivos e as coisas podem ficar relativamente grandes rapidamente se você instalar vários aplicativos de loja.
Essa pasta não é apenas oculta, mas você, o usuário (ou até mesmo o administrador) não tem permissão para lê-los e você também não é o proprietário. Isso pode evitar que a pesquisa ou o clique com o botão direito do mouse em + propriedades em uma pasta os contenha. Pode haver outros arquivos nesse estado bloqueado na unidade C, mas esse seria o maior problema possível.
Veja esta resposta para mais detalhes sobre como acessar a pasta WinApps.
Eu não aconselho excluir tudo o que estiver lá, mas não tive problemas (até agora!) para excluir pastas que eu sabia que não estava usando.
Editar: experimente o utilitário gratuito TreeSize e veja os resultados obtidos. Eu observei pela primeira vez a pasta WindowsApps usando-a, por isso parece um rastreador de HDD confiável.