Sim, desde que você não tente nada de estranho, como hibernar um sistema operacional e, em seguida, inicializar diretamente em outro e não esperar nenhum problema. (Uma versão da hibernação salvará o ram diretamente na partição swap.).
Tudo o que você precisa fazer é certificar-se de que cada O / S instalado instala a partição de troca correta.