Como explicado no Perguntas e amp; Respostas da seção de suporte NTFS-3G, excluindo um ponto de nova análise não é totalmente suportado pelo driver NTFG-3G. Pode ser necessário instalar o driver Advanced NTFS-3G:
Why do I get an "Operation not supported" message when deleting a file?
The NTFS-3G 1.5012 driver has solved this issue, or you're trying to delete an NTFS Reparse Point which is not fully supported yet in Stable NTFS-3G, only in the Advanced NTFS-3G version of the driver.
Não posso fornecer orientação mais específica sem mais informações sobre sua distribuição, versão, etc. do Linux.