Você removeu a unidade original ou a colocou em, por exemplo, um caddy óptico para armazenamento extra? O firmware EFI usa uma assinatura para encontrar o bootloader, não o número da porta do barramento, então ele usará o disco giratório para as partes iniciais do processo de inicialização se esse disco estiver presente.
Meu colega de trabalho teve problemas parecidos, em que procurava o disco correspondente à assinatura e demorava ainda mais, se não estivesse presente. Esqueço o que consertou para ele, vou ver se ele se lembra.
Reconfigure o EFI e selecione a configuração do dispositivo de inicialização, mesmo que ele ainda esteja inicializando, pois ele pode estar tentando usar uma configuração existente e voltar a uma pesquisa legada / compatível somente depois que todas as novas tentativas falharem.