É seguro. O OS X provavelmente está apenas detectando que o arquivo está sendo usado por algum programa ou em execução. Se você sabe que realmente quer que ele desapareça, rm
it. A próxima reinicialização, seja qual for o processo que estava usando, desaparecerá.
SEJA CUIDADO usando rm -r
Ele recursivamente exclui todos os subdiretórios abaixo do diretório especificado. Se você não estiver familiarizado com shells, sugiro usar apenas rm
e especificar explicitamente os arquivos que deseja excluir (embora você tenha dito que há muitos arquivos).
Tente isto:
rm -r ~/.Trash/*
Isso removerá todos os arquivos e pastas da pasta .Trash, sem excluir a pasta .Trash.