Eu acho que você deveria usar o Wine.
sudo apt-get install wine
wine dir/WAV2RAW.exe
Ou Mono se você sabe que o exe é um aplicativo .NET:
sudo apt install mono-runtime
mono dir/WAV2RAW.exe
É possível executar um arquivo .exe no Ubuntu em um script? Por exemplo, um código simples do Matlab como este:
system("dir/WAV2RAW.exe")
Eu acho que você deveria usar o Wine.
sudo apt-get install wine
wine dir/WAV2RAW.exe
Ou Mono se você sabe que o exe é um aplicativo .NET:
sudo apt install mono-runtime
mono dir/WAV2RAW.exe
Como mencionado nos comentários, isso pode ser um problema XY
Você pode usar o 'sox' para converter de tipos de arquivo raw para wav:
sudo apt install sox
instalará o programa e, em seguida,
sox --type raw <infile> --type wav <outfile>
realizaria uma conversão simples dos formatos raw para wav
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