Se você tem CPU recente (e o software de criptografia é escrito de forma inteligente (como deveria)), ele deve usar suas extensões cpu (não sei quais, mas eu sei que o Intel Core i3, i5, i7 tem) facilitar o processo de criptografia. (Sem essas extensões, ele funciona da mesma forma, mas o desempenho é reduzido, pois a CPU tem mais trabalho a fazer, mas não é muito). Mas ... os discos rígidos clássicos são lentos, a CPU é rápida, o que significa que o maior desempenho está no disco, não na CPU, mesmo quando você copia o arquivo XGB e o criptografa imediatamente.
Quando você tem disco SSD, o caso é totalmente diferente. A queda de desempenho é maior em comparação com a taxa de transferência bruta de leitura / gravação de SSD.
[Eu li isso quando estudei como o FileVault 2 no meu Mac funciona e, como você, eu estava preocupado com o desempenho.]
Além disso, ele deve fazer a criptografia quando a CPU estiver no estado inativo. Então, quando você está fazendo um trabalho normal (e não copiando o arquivo XGB, por exemplo), você não deve notar a queda de desempenho (mesmo que você não tenha essas extensões de suporte).