Isso é por design. O TrueCrypt bloqueia o contêiner de arquivos para impedir que qualquer outro aplicativo acesse o arquivo e corrompa os dados. Você terá que desmontar periodicamente o contêiner para permitir que o OwnCloud sincronize o arquivo.
Eu tentei o software de sincronização OwnCloud recentemente e funciona muito bem.
Ele sincroniza todos os arquivos rapidamente, mas estou um pouco preocupado com a segurança.
Então, minha ideia era colocar meus arquivos privados em um arquivo contêiner TrueCrypt e depois colocar esse arquivo contêiner em uma pasta OwnCloud WebDAV para que fosse sincronizado e feito backup automaticamente.
Mas, ao contrário dos arquivos comuns, meu contêiner de arquivos TrueCrypt não sincroniza com o armazenamento OwnCloud até que seja desmontado.
Eu posso fazer alterações nos arquivos no contêiner do arquivo e na data de modificação desse contêiner ( ls -al mostra claramente isso), mas o próprio contêiner de arquivo não está sincronizado.
Ele é sincronizado somente quando eu desmonto meu contêiner de arquivos TrueCrypt.
Existe alguma maneira de corrigir esse comportamento estranho do contêiner de arquivos TrueCrypt e sincronizá-lo com o OwnCloud automaticamente sem desmontá-lo?