Inicialize a partir do DVD de instalação do Mac OS X Snow Leopard e, no menu "Utilitários", escolha "Utilitário de disco". De lá você pode reformatar seu disco rígido. Depois disso, feche o Utilitário de Disco e você poderá executar uma instalação limpa.
EDIT : Aparentemente, há também uma opção "Apagar e instalar". (Eu não usei isso antes de mim mesmo). Veja mais detalhes aqui .
Veja um artigo oficial de suporte da Apple sobre todas as opções de instalação disponíveis.
Depois de postar isso, ocorreu-me que, embora sua pergunta indique claramente que você deseja formatar seu disco, gostaria de mencionar que isso apagará todos os dados do disco, incluindo aplicativos e seus dados . Então faça um backup primeiro . Alternativamente, você poderia simplesmente executar um "Arquivo e Instalar", que lhe dará um sistema operacional limpo, mas deixará seus dados e aplicativos intactos.