Seu erro está em -acodec libx264 .
Digite ffmpeg -codecs em cmd e procure em libx264:
EV libx264 libx264 H.264 / AVC / MPEG-4 AVC / MPEG-4 part 10
Você verá "EV", onde "E" significa Encode, "V" significa codec de vídeo. Não há "A", o que significa que você não pode usar o libx264 como codec de áudio. Consequentemente -acodec libx264 é falso.
Agora, a resposta - tente usar outro codec de áudio, por exemplo, aac , o codificador AAC integrado:
ffmpeg -i recod_audio.wav -i recod_ideo.flv -c:a aac -strict -2 -c:v libx264 output.flv
Ou MP3:
ffmpeg -i recod_audio.wav -i recod_ideo.flv -c:a libmp3lame -ar 44100 -c:v libx264 output.flv