Eu gostaria de sugerir o CD link (gratuito) do livro Ultimate e vem com muitas ferramentas que ajudarão. Especialmente o que você está procurando é um utilitário de partição. Fdisk Eu acredito que é a ferramenta particular que você estará usando para refazer suas partições. Outra opção é também usar um live CD do linux e usar o gparted. De qualquer forma, você pode excluir todas as partições e criar apenas uma partição grande para colocar a instalação do Windows.