A tecla ALT não envia um código de chave específico para o terminal; em vez disso, modifica o código de chave enviado por outra chave quando ela é pressionada simultaneamente. Como tal, a tecla ALT por si só não pode ser usada como o prefixo tmux.
[Edit: Como Keith aponta, o seguinte irá tecnicamente funcionar, mas quase certamente não se comportará como você gosta.]
Uma solução alternativa pode ser configurar sua configuração local ou emulador de terminal para alterar o comportamento da tecla ALT, talvez para atuar como a tecla Escape. Então, o seguinte poderia funcionar:
set-option -g prefix Escape