As razões pelas quais o AFAIK é apenas o desempenho. Não há uma razão técnica real contra isso.
Existe uma diferença entre um ataque de 3 discos e um de 3 discos. Os cálculos de redundância para o raid-6 são computacionalmente mais difíceis e mais complexos do que para o raid-1. Portanto, usar um ataque de 3 discos requer muito mais potência do controlador (hardware) ou da CPU (software-raid). Recriações, se necessário, também consomem mais tempo.
Por isso, não faz sentido fazer o raid-6 em 3 discos quando o raid-1 fornece o mesmo nível de redundância com menos problemas de desempenho.
Como resultado, a opção por um ataque de 3 discos em 3 normalmente nem é disponibilizada pelos programadores do software de gerenciamento do ataque.
(Se bem me lembro eu vi um controlador RAID há alguns anos que permitiu. Eu não posso lembrar a marca / modelo, mas quase tinha que ser um controlador Areca ou um dos controladores HP / Compaq Proliant. estavam lidando quase exclusivamente com aqueles na época.)