Algumas placas-mãe permitem o carregamento variável em sua energia fornecida aos dispositivos, que usam reguladores de voltagem de alta frequência. Estes são semelhantes aos VRMs na sua placa gráfica. Sob carga, o ciclo de trabalho e a frequência dos reguladores de tensão aumentam para melhorar a estabilidade do sistema (com o custo de mais calor).
Isso também pode apresentar outro efeito colateral, um gemido agudo. Infelizmente, pode ser difícil apontar, mas como você disse, você está usando CUDA / OpenCL. Eu assumirei, por razões de argumentos, que você os implementou apenas, já que você tem um cartão que suporta a computação da GPU, , então eu apontaria meus olhos para a GPU . (Atualização do autor da pergunta, o descarregamento da computação da GPU não ajudou)
Caso isso aconteça, você pode querer considerar os reguladores de potência da placa-mãe (eu sei que as placas-mãe ASUS geralmente são bastante personalizáveis). Pode ser apenas uma frequência específica que causa o ruído que você sente, e você pode ser capaz de definir a frequência do VRM manualmente.