Qual aplicativo FTP você está usando? Se você usar algo como o modo de disco da transmissão, poderá fazê-lo como faria normalmente.
EDIT: Eu realmente acabei de descobrir uma maneira, embora seja um pouco áspero.
- Abra dois (ou mais arquivos) de seu aplicativo FTP
- No TextMate, clique em Arquivo - Novo projeto
- Arraste o ícone de uma janela do editor para a barra lateral do projeto
- Feche a janela do editor do arquivo que você acabou de adicionar ao projeto
- Repita 3 e 4 até ter todos os arquivos.
Além disso, aqui está um screencast: link
Você também pode usar esse AppleScript simples para combinar todos os documentos abertos em um projeto:
tell application "TextMate"
activate
set openFiles to {}
repeat with doc in (every document whose name is not "untitled")
set openFiles to openFiles & path of doc
end repeat
open openFiles
end tell
Basta colá-lo no editor do AppleScript e executá-lo. Ele deixará as janelas individuais abertas (não consegui descobrir como fechá-las automaticamente), mas isso deve facilitar muito o processo.