Você pode olhar a guia System Preferences->Keyboard->Keyboard Shortcuts para ver os atalhos atribuídos e excluí-los.
Você também pode detectar conflitos nos atalhos do teclado seguindo as instruções da página (ele diz "Leão", mas também pode se aplicar ao "Leão da montanha"): OS X Lion: Se um atalho de teclado não funcionar
Você pode ter excluído o aplicativo Synergy da sua pasta Aplicativos, mas não excluído o arquivo de preferência (plist), que é onde os atalhos personalizados seriam armazenados. O arquivo de Preferência geralmente está localizado em /Users/<yourusername>/Library/Preferences/ e, para esse caso específico, o arquivo deve estar com algo como com.wincent.synergy.plist (supondo que o Synergy seja de wincent.com). A exclusão desse arquivo pode ajudar.