Você pode tentar navegar para
System -> Library -> LaunchDaemons
e edite o arquivo abaixo
com.apple.backupd-auto.plist
Aparecerá de esta página do manual da Apple referenciando o launchd que você poderia adicionar uma chave para
LowPriority I / O que pode conseguir isso.
Neste mesmo .plist, você também pode alterar a frequência dos backups alterando o valor da tecla Start Interval:
<key>StartInterval</key>
<integer>3600</integer>
O 3600 representa segundos, portanto, aumentar isso atrasará o tempo entre os backups.
Dito isto, é provavelmente melhor não alterar também o comportamento padrão do Time Machine editando o .plists. Pode ser melhor simplesmente desligar o Time Machine de seu painel de preferências manualmente se você acha que ele vai te atrapalhar. (E, claro, lembrando-se de ligá-lo novamente quando você deixar a máquina desacompanhada depois).