O Setup.exe não o força a atualizar. Basta clicar no botão "Manter" no canto superior direito da tela de seleção de pacotes para dizer a ele para ficar com a sua versão atual. Use a visualização "Parcial" para ficar de olho no que vai mudar. Se você ainda está no Cygwin 1.5, talvez queira usar o link .
Sem setup.exe, você pode encontrar a lista de arquivos instalados por cada pacote nos arquivos .lst.gz em / etc / setup.