Em um ano, muita poeira pode se acumular no filtro do ventilador.
A alteração do disco rígido pode ter levado a um aumento na temperatura interna cruzando um limite, fazendo com que o ventilador permaneça ligado.
Ou, como você diz, pode ser relacionado ao driver. Eu tive esse problema com o Ubuntu até que eu instalei os drivers adequados para a minha placa gráfica.