Você pode fazer isso com o CCSM ou o Compizconfig-settings-manager.
Instale-o com este comando.
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
Abra e ative o plug-in Regras de janela na seção Gerenciamento de janelas . Vá para as configurações, Na guia Correspondências , haverá opções para configurações de vários tipos de regra para janelas.
Use a opção Above
lá. Você tem que adicionar o tipo de janela a ele. Então as janelas dessa classe sempre estarão acima das outras.
Para a janela de diálogo, você precisa adicionar type=Dialog
no campo acima. Assim
Você pode até usar o botão + para capturar a classe ou o tipo de janela. Clique no ícone, na nova janela, clique no botão Grab . O ponteiro agora se tornará um ícone de cruz. Clique na janela para a qual você deseja definir a regra.
Faça experiências com a turma e os tipos para encontrar a correspondência exata.