Isso é um pouco atrasado, mas você pode fazer com que o outro lado use o comando /alertson OK
do Skype, dentro da janela de bate-papo requerida.
Isso fará com que o Skype apenas os notifique sobre mensagens que contenham a palavra "OK".
Apenas certifique-se de que o outro lado não se esqueça de desativá-lo com /alertsoff
quando terminar.