Dada a descrição do congelamento que você está descrevendo, isso parece um problema no nível do hardware, mas não necessariamente causado pela CPU. Dito isto, um sistema multi-CPU pode definitivamente se enredar em um impasse em todos os núcleos, se cada um estiver executando um encadeamento ou processo que esteja aguardando em um recurso alocado pelo outro processo / encadeamento. Uma pesquisa sobre "deadlock da CPU" fornece muitos detalhes sobre possíveis condições. Uma falha devido a superaquecimento ou configurações de voltagem impróprias também pode causar um comportamento intermitente - embora eu tenha visto apenas o desligamento do sistema ou se recusado a fazer o POST quando este for o caso.
FYI - Eu vi problemas semelhantes em sistemas com cartões de memória ruins e placas de vídeo ruins. Você pode tentar executar alguns diagnósticos de burn-in, como o MemTest +, e / ou comparar o sistema com diferentes peças de hardware removidas para ver se é possível isolar o (s) componente (s) instável (s).