Infelizmente, não é possível desativar o segundo monitor enquanto mantém a área de trabalho virtual intacta. A área de trabalho virtual (a grande área de trabalho que você usa em vários monitores) é totalmente integrada ao driver de vídeo e aos monitores. Sua melhor aposta é não colocar nenhum atalho na segunda área de trabalho, portanto, desabilitar o segundo monitor só reduzirá o tamanho da área de trabalho e não atrapalhará seus ícones.
Além disso, a desativação de minidores adicionais tem muito pouco impacto no desempenho do jogo, já que o fator limitante do jogo são os gráficos 3D e não está afetando os desktops adicionais, se não estiver configurado. Seu problema pode estar na placa de vídeo usada, já que a Radeon HD 5250 é uma placa de vídeo de baixo custo por si só.
Você pode verificar o desempenho da sua placa de vídeo neste site: link