Sim. Ele é chamado de campo "Extra"
Muitos programas diferentes usam esse campo para seus próprios propósitos; Não podemos recomendar um se não soubermos quais são seus objetivos.
Existe alguma maneira padrão de armazenar metadados (por exemplo, registros de data e hora) dentro de arquivos ZIP, junto com os arquivos?
Qual programa eu precisaria usar para fazer isso?
Sim. Ele é chamado de campo "Extra"
Muitos programas diferentes usam esse campo para seus próprios propósitos; Não podemos recomendar um se não soubermos quais são seus objetivos.
Um manifesto Java JAR é um arquivo de metadados e um arquivo JAR é uma forma especial de arquivo ZIP. Basicamente, você pode colocar qualquer arquivo que quiser dentro do arquivo ZIP e chamá-lo de "metadados".
Você sempre pode envolver um arquivo xml em torno do zip que inclui os metadados e o caminho para o zip, fornecer sua própria extensão e escrever um manipulador padrão para a nova extensão que obtém os metadados e abre o zip.