Sim ... isso acontece. Você está executando uma máquina em uma máquina, e há uma tonelada de sobrecarga, para não mencionar problemas com a prioridade da CPU para sua máquina virtual e quais não. Além disso, isso é muita memória RAM em uma VM ... quanto você tem no seu PC?
Este é um problema muito comum. Pelo menos no Winamp, você pode aumentar o buffer para a reprodução da placa de som. Eu imagino que você pode fazer o mesmo no Windows Media Player. Isso pode ajudá-lo, mas tenha em mente que a placa de som também é controlada por software.