Em Putty e ZOC você pode pressionar Ctrl + 5 (eles entendem Ctrl + 2 ... Ctrl + 7 para os códigos de controle arcanos, este é um recurso DEC antigo dos dias do VT220).
Além disso, no Putty você pode pressionar o combo do teclado dos EUA (Ctrl e qualquer tecla que esteja à esquerda da tecla Enter no seu teclado no lugar onde o teclado dos EUA tem a tecla "]".
E, claro, em ambos você pode usar o recurso de remapeamento do teclado para colocar "^]" em qualquer tecla conveniente.