(Não é uma resposta completa, mas talvez seja útil)
Para a parte mid
+ Thunderbird de sua pergunta (no entanto, observe que eu não testei esses complementos ainda, então não tenho certeza se eles realmente usam mid
URIs ou algum protocolo proprietário):
A descrição do complemento do Thunderbird ThunderLink diz (negrito por mim):
ThunderLink lets you link to email messages in Thunderbird.
[…]
ThunderLinks are based on the unique message ID generated when an email is sent.
O complemento complementar do Firefox ThunderLinkSpotter
[…] enables the browser to recognize ThunderLinks and turn them into hyperlinks.
Outro complemento do Thunderbird é o MessageID-Finder , que permite abrir e-mails de clicando em um id de mensagem (veja uma captura de tela no site ). Mas isso só funcionaria no Thunderbird.