Eu tive um problema semelhante, mas não idêntico, com o host do Windows 7 e o convidado do Linux Mint. Minha solução até agora é desabilitar e reativar o mouse, e o comportamento da roda de rolagem retorna ao padrão original.
Eu tenho convidados do Windows 7 e Windows XP no Virtualbox 4.1.20 r80170 no host Ubuntu 12.04 de 64 bits, e quando no convidado do Windows, um rolagem horizontal da roda do mouse se torna o evento alt-vertical-scroll (com efeito semelhante a page-up / down). Isso é muito chato como sempre que eu acidentalmente toque roda de rolagem horizontal a página inteira salta para cima ou para baixo uma página inteira ou mais. Isso acontece tanto dos meus mouses. Eu tenho a última adição de convidado instalada nos sistemas operacionais Windows 7 e XP. Tentei o modo PS2 e a modalidade de posição absoluta (por exemplo, modo tablet) emulação de mouse HID na configuração de virtualbox, com o mesmo resultado. Não consigo encontrar nenhuma menção a este problema após uma hora de pesquisa.
BTW, o mesmo Virtualbox com um convidado do Ubuntu funciona bem, por exemplo a roda de rolagem horizontal e vertical do mouse funciona normalmente.
Se não puder ser corrigido, por exemplo roda de rolagem horizontal para rolar horizontalmente, então eu não me importo se houver uma maneira de desativar os eventos de roda de rolagem horizontal da configuração de máquina convidado .vbox do Virtualbox. Ou, se houver software no Windows (no convidado) que possa interceptar e remover eventos de rolagem vertical alternada ou tratamento de eventos (por exemplo, no regedit) também seria ótimo.
Eu tive um problema semelhante, mas não idêntico, com o host do Windows 7 e o convidado do Linux Mint. Minha solução até agora é desabilitar e reativar o mouse, e o comportamento da roda de rolagem retorna ao padrão original.