O destaque que você está vendo aqui está relacionado a instâncias de variáveis. Você pode desativar o realce de cor na tela de preferências como uma solução permanente, mas eu desestimulo que as instâncias de destaque sejam inestimáveis!
Em vez disso, você pode facilmente resolver isso cada vez colocando seu cursor em uma variável diferente. Pode requerer um salvamento intermediário.
Eu já vi esse tipo de comportamento estranho muito raramente; talvez você também deva se certificar de que está usando a versão recente do Eclipse.