FYI -
Eu tenho o mesmo problema recorrente. Reboot corrigiu, mas isso apareceu novamente aleatoriamente. Com base em documentos do Putty, adicionei a entrada do Registro para RandSeedFile, conforme mostrado abaixo e criei um arquivo em branco nesse local. Corrigiu o problema por enquanto, sem reinicialização.
[HKEY_CURRENT_USER \ Software \ SimonTatham \ PuTTY] "RandSeedFile"="c: \ apps \ putty.rnd"
Espero que ajude.