Você pode usar o caminho absoluto para startup.sh
sem cd
na pasta onde está localizado:
alias startTomcat="~/apache-tomcat-7.0.34/bin/startup.sh"
Ou, você pode usar cd -
, que retornará ao diretório em que estava na última vez:
alias startTomcat="cd ~/apache-tomcat-7.0.34/bin/ && ./startup.sh && cd -"