Como eu disse no comentário, a macro AutoHotKey pode ajudar a alcançar o que você espera:
WheelDown::
GetKeyState state, RButton, P ; get state of right mouse button
If (state = "U") { ; U = up
Send {WheelDown}
}
Return
WheelUp::
GetKeyState state, RButton, P ; get state of right mouse button
If (state = "U") { ; U = up
Send {WheelUp}
}
Return
Eu testei, funciona.
Se você quiser restringi-lo apenas ao Notepad ++, adicione #IfWinActive directiva