Você provavelmente ainda não perdeu nenhum dado, então não acho que seja importante descobrir quais arquivos específicos foram armazenados nos setores defeituosos. Quando um disco rígido detecta uma anomalia em um setor (velocidade de leitura / gravação mais lenta que o normal, por exemplo), ele move imediatamente todos os dados armazenados para um setor em um pool especial de "reserva". Em seguida, marcará o setor do problema como "ruim" para garantir que ele nunca seja usado novamente. É somente quando você exaure todo o pool de reservas que você começa a perder dados.
Em vez de tentar descobrir quais arquivos estão em setores defeituosos, você deve IMEDIATAMENTE fazer o backup de todos os dados importantes nesta unidade. Mesmo um único setor ruim é um problema sério e pode indicar que a falha do drive é iminente; 4KB de setores defeituosos é bastante substancial. Quando um setor falha, outros freqüentemente (mas nem sempre) seguirão. Depois de ter feito backup de seus dados, instale um programa de monitoramento S.M.A.R.T (há muitos por aí; basta pesquisar no Google) e verifique a contagem de setores defeituosos regularmente. Se aumentar, substitua a unidade.