Você pode usar o plug-in de comparação para isso.
Existe um tutorial bastante fácil no link
Há apenas um problema, você não pode abrir um arquivo várias vezes no Notepad ++. Então você deve clicar em Nein (Não) na janela de diálogo. Em seguida, copie a versão antiga para um arquivo ou janela diferente e reabra o arquivo novamente. Então você pode compará-los.