Você deseja formatar a unidade usando Fat32, o que é mais legível. Não tenho certeza sobre o procedimento do Mac, mas para formatar a unidade no Windows, clique com o botão direito em (Meu) Computador e selecione "Formatar ..." Defina o sistema de arquivos como Fat32 (deve ser o padrão, mas você deve ter certeza). Além disso, certifique-se de que "Quick Format" esteja desmarcado, pois ele não apaga os dados. Em seguida, clique em OK e ele começará a formatar a unidade. Ele irá avisá-lo, mas vou reiterar (prefixar?) NÃO REMOVER A UNIDADE NESTE MOMENTO. Também esteja ciente de que isso removerá todos os arquivos, embora não necessariamente com segurança.
Além disso, dependendo da sensitividade da informação e das pessoas que você tem medo pode lê-la, você pode querer fazer mais procedimentos de apagamento. Eu sei que o Mac permite que você exclua arquivos com segurança. Você precisa fazer isso ANTES de reformatar a unidade ou não haverá arquivos para apagar com segurança.
EDIT (anos depois): Você também pode tentar formatando a UDF da unidade flash . Isso é mais difícil do que formatá-lo FAT32, mas pode armazenar arquivos grandes e tem alguns outros recursos interessantes. Como o UDF é um sistema de arquivos que os discos ópticos (CD, DVD, etc.) usam com frequência, ele é entendido por todos os principais SOs.