Sim, o meu ocasionalmente também, é um bug não reconhecido na versão mais recente do flash.
Não demorou muito para o Google e encontrar muitas outras pessoas com o mesmo problema (não importa se você usa o Chrome, Firefox ou IE).
Eu estava navegando no fórum da Adobe recentemente e encontrei uma página link para esta . A Adobe não parece apoiar as pessoas em seus próprios fóruns, mas pague a empresa e monitore3ixas aqui!
Eu não sei o que está causando isso, pois eu fiz um site em flash muito intensivo e a CPU não faz muito esforço, já que um simples anúncio pequeno nos outros causa 100% de CPU conforme você reporta. Quando instalei o Adblock Plus, ele bloqueou esses anúncios e a CPU estava normal.
Não ajuda em alguns sites onde há necessidade de flash que causa problemas. Não tenho ideia de quais recursos no flash realmente causam isso.
* Eu sei que é flash porque como um teste eu rebaixei a versão e a CPU nunca ultrapassou 30% em algumas páginas, então no momento que atualizei para a última, a mesma página pulou para 100%