Sim.
Em outras palavras, depende de como o caso é organizado - se você simplesmente colocar alguns componentes na placa, é possível que o efeito de resfriamento do fluxo de ar seja insignificante; OTOH, em um caso bem projetado, há um fluxo de ar controlado de pontos de entrada através do gabinete até um ponto de saída, precisamente para melhorar o resfriamento.
Observe que há outros fatores em jogo aqui - por exemplo, limpeza do ambiente (caso contrário coelhinhos de poeira), temperatura ambiente, fluxo de ar fora do gabinete (nenhum ponto em qualquer ventilação se o gabinete estiver trancado em um gabinete de armazenamento), umidade, etc.
Então não, não há uma resposta para ordená-los todos.