Eu percebo que isso não é exatamente uma "GUI", mas você não disse nada por que é um requisito, e existem linhas de comando já escritas ferramentas que fazem isso; por exemplo. perl-rename
:
find ~/dir -type f -exec prename -n 's/^(\d\d)(\d\d)(\d\d)(.*)$/$3$1$2$4/' {} +
( -n
ativa o modo "teste". Quando estiver satisfeito com a saída, execute novamente com -v
ou nenhuma opção).