Você pode usar o utilitário padrão do UNIX dd
conecte a unidade flash que você deseja clonar
terminal aberto (tecla Apple + espaço ou tecla Apple + f, o que acionar a caixa de pesquisa [esqueci] e digite terminal e pressione enter)
tipo
dmesg | tail -n 10
é um pipe não um L (geralmente na tecla de barra invertida)
pressione enter. Verifique qual drive apareceu. Vou usar sd2 para o meu exemplo (pode ser ada1, ou sda1, etc)
sudo dd if=/dev/sd2 of=usb.img bs=4096
depois, desconecte o pen drive quando terminar. ligue o em branco.
sudo dd if=usb.img of=/dev/sd2 bs=4096
para criar uma imagem da unidade flash USB em branco. É recomendável verificar se a segunda unidade USB recebeu o mesmo nome de dispositivo. Provavelmente foi.