Normalmente, não há necessidade de um software de limpeza para acelerar uma máquina Ubuntu. Não há registro no Linux e os arquivos temporários estão no diretório /tmp , que não é salvo quando você desliga a máquina.
Os arquivos de log estão em /var/log e não têm absolutamente nada a ver com a velocidade da máquina (embora não encham o disco, é claro). Cada log tem vários arquivos porque os antigos são compactados e um novo é criado. Os compactados (antigos) geralmente estão no formato /var/log/logfilename.#.gz . Geralmente, 2 arquivos de cada log não são compactados, o atual e o anterior (geralmente denominado logfilename.1 ). Ele não é necessário e não acelera a sua máquina, mas se você precisar de algum espaço extra em disco, poderá excluir todos os compactados, se não precisar deles ( sudo rm /var/log/*.gz deve funcionar, mas talvez seja necessário fazer algumas adaptações dependendo dos nomes dos seus arquivos de log).
Algumas pequenas coisas que você pode fazer manualmente:
Devido às instalações de dependências automáticas do gerenciamento de pacotes, você pode ter o pacote instalado automaticamente que não é mais necessário. Remova-os com: sudo apt-get autoremove
Olhe para o seu swap para ver se ele é usado pesadamente (RAM não é suficiente):
free -m
A última linha irá dizer-lhe o tamanho do swap, usado e livre. Se o uso for alto e você ver na linha acima -/+ buffers/cache que a memória livre é curta, você pode precisar aumentar sua memória RAM para acelerar sua máquina. Se swap estiver perto de 100% usado, você precisa aumentar o espaço de swap (mas essa é outra questão :))
Os caches dos navegadores normalmente podem ser limpos das preferências do navegador.
Ou, como sugerido em outras respostas, você pode usar o Ubuntu Tweak! :)