Resposta curta: no XP 'não' - não está usando um esquema de particionamento moderno. A resposta no Vista / 7 é 'sim'.
Resposta longa: na verdade, alinhando-o corretamente pode ser uma dor, dependendo do software que você tem disponível - algumas das coisas ligadas nesse segmento e nesse fórum é bom. A coisa mais simples a fazer é criar as partições em um sistema operacional que as execute corretamente, mover a unidade e instalá-las. Existem alguns aplicativos que farão isso no local para partições existentes - Eu tive sorte com o produto da Paragon .