O que você está vendo não é realmente um conector quebrado. Esses pinos são mantidos intencionalmente curtos para que se conectem por último. Lembre-se que PCIe é capaz de hot plug, você pode adicionar (e teoricamente também remover) cartões em um sistema em execução. Se você olhar dentro de um plugue USB, poderá ver algo semelhante: Os pinos de dados são mais curtos que os pinos da fonte de alimentação.
O pino curto perto da parte traseira do cartão é "PRSNT2 #". O da frente é “PRSNT1 #”. Ele está conectado ao pino traseiro e informa a placa-mãe sobre o comprimento (nos canais PCIe) da placa. Existem várias localizações possíveis de “PRSNT2 #”, uma para cada tamanho de placa possível.
Você pode ler mais sobre o conector PCIe em Wikipedia .