Sim, é possível (embora possa depender do cliente de torrent).
Quando eu estava tendo problemas de disco rígido, meu cliente de torrent (Deluge) costumava relatar arquivos como baixados 100%
, quando algumas partes deles estavam realmente defeituosas. Uma nova verificação forçada corrigiu isso.
Se você forçar uma nova verificação e os arquivos ainda parecerem estar corretos, é provável que seja um torrent ruim ou que você tenha problemas com o seu computador. Uma colisão de hash é teoricamente possível, mas altamente improvável na prática.