É definitivamente possível que um sistema Windows de 64 bits seja infectado por vírus de 32 bits. Desde que haja algum tipo de compatibilidade de 32 bits, um computador pode ser afetado por um vírus de 32 bits.
É bastante seguro assumir que o MSE detectará vírus de 32 bits em um sistema operacional de 64 bits porque, se não o fizesse, a Associated Press teria esfaqueado a Microsoft no pescoço até agora.