Como usar o gcc com o LAPACK e o arquivo de cabeçalho externo?

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Eu estou tentando executar um programa em C que usa um arquivo de cabeçalho externo com bibliotecas LAPACK E LBLAS, toda vez que tento executar o programa eu recebo um lapack de erro não encontrado, Como faço para usar corretamente as bibliotecas para executar o programa.

ubu@sanjay-pc:~$ ./code
*** glibc detected *** ./code: free(): invalid next size (normal): 0x08f64eb8 ***
======= Backtrace: =========
/lib/i386-linux-gnu/libc.so.6(+0x75ee2)[0xb6cf4ee2]
/usr/lib/libblas.so.3gf(ATL_dtrsmKLUNN+0x603)[0xb6ad8973]
======= Memory map: ========
08048000-0804a000 r-xp 00000000 08:0c 697362     /home/ubu/code
0804a000-0804b000 r--p 00001000 08:0c 697362     /home/ubu/code
0804b000-0804c000 rw-p 00002000 08:0c 697362     /home/ubu/code
08f30000-08f72000 rw-p 00000000 00:00 0          [heap]
b57cb000-b57cc000 ---p 00000000 00:00 0 
b57cc000-b5fcc000 rw-p 00000000 00:00 0 
b5fcc000-b5fcd000 ---p 00000000 00:00 0 
b5fcd000-b67ce000 rw-p 00000000 00:00 0 
b67ce000-b6840000 r-xp 00000000 08:0c 5026       /usr/lib/i386-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
b6840000-b6841000 r--p 00071000 08:0c 5026       /usr/lib/i386-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
b6841000-b6842000 rw-p 00072000 08:0c 5026       /usr/lib/i386-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
b6842000-b6843000 rw-p 00000000 00:00 0 
b6843000-b685a000 r-xp 00000000 08:0c 689952     /lib/i386-linux-gnu/libpthread-2.15.so
b685a000-b685b000 r--p 00016000 08:0c 689952     /lib/i386-linux-gnu/libpthread-2.15.so
b685b000-b685c000 rw-p 00017000 08:0c 689952     /lib/i386-linux-gnu/libpthread-2.15.so
b685c000-b685e000 rw-p 00000000 00:00 0 
b685e000-b687a000 r-xp 00000000 08:0c 656309     /lib/i386-linux-gnu/libgcc_s.so.1
b687a000-b687b000 r--p 0001b000 08:0c 656309     /lib/i386-linux-gnu/libgcc_s.so.1
b687b000-b687c000 rw-p 0001c000 08:0c 656309     /lib/i386-linux-gnu/libgcc_s.so.1
b687c000-b697a000 r-xp 00000000 08:0c 10434      /usr/lib/i386-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
b697a000-b697b000 r--p 000fe000 08:0c 10434      /usr/lib/i386-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
b697b000-b697c000 rw-p 000ff000 08:0c 10434      /usr/lib/i386-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
b697c000-b697d000 rw-p 00000000 00:00 0 
b697d000-b6c4e000 r-xp 00000000 08:0c 41489      /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3gf.0
b6c4e000-b6c52000 rw-p 002d1000 08:0c 41489      /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3gf.0
b6c52000-b6c7c000 r-xp 00000000 08:0c 690058     /lib/i386-linux-gnu/libm-2.15.so
b6c7c000-b6c7d000 r--p 00029000 08:0c 690058     /lib/i386-linux-gnu/libm-2.15.so
b6c7d000-b6c7e000 rw-p 0002a000 08:0c 690058     /lib/i386-linux-gnu/libm-2.15.so
b6c7e000-b6c7f000 rw-p 00000000 00:00 0 
b6c7f000-b6e23000 r-xp 00000000 08:0c 691765     /lib/i386-linux-gnu/libc-2.15.so
b6e23000-b6e25000 r--p 001a4000 08:0c 691765     /lib/i386-linux-gnu/libc-2.15.so
b6e25000-b6e26000 rw-p 001a6000 08:0c 691765     /lib/i386-linux-gnu/libc-2.15.so
b6e26000-b6e29000 rw-p 00000000 00:00 0 
b6e29000-b75f0000 r-xp 00000000 08:0c 41490      /usr/lib/atlas-base/atlas/liblapack.so.3gf.0
b75f0000-b75f4000 rw-p 007c6000 08:0c 41490      /usr/lib/atlas-base/atlas/liblapack.so.3gf.0
b75f4000-b7701000 rw-p 00000000 00:00 0 
b7719000-b771c000 rw-p 00000000 00:00 0 
b771c000-b771d000 r-xp 00000000 00:00 0          [vdso]
b771d000-b773d000 r-xp 00000000 08:0c 689978     /lib/i386-linux-gnu/ld-2.15.so
b773d000-b773e000 r--p 0001f000 08:0c 689978     /lib/i386-linux-gnu/ld-2.15.so
b773e000-b773f000 rw-p 00020000 08:0c 689978     /lib/i386-linux-gnu/ld-2.15.so
bfc14000-bfc35000 rw-p 00000000 00:00 0          [stack]
Aborted
    
por kernel_panic 20.01.2014 / 06:44

1 resposta

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Você precisa instalar o lapack e o libblas .

sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install liblapack*
sudo apt-get install libblas*

O verdadeiro truque está em chamar as funções da biblioteca e vinculá-las.

LAPACK

Cabeçalho

Nenhum cabeçalho especial é necessário. Somente os cabeçalhos comuns estarão disponíveis.

#include <stdio.h>
#include <math.h>

Função protótipo e chamada de função

Todas as funções devem anexar sublinhado ( _ ) ao declarar protótipo e chamada. É importante. Digamos que eu chame uma função zheev do lapack. Seu protótipo deve ser como,

extern void zheev_( char* jobz, char* uplo, int* n, dcomplex* a, int* lda,
            double* w, dcomplex* work, int* lwork, double* rwork, int* info );

Vincule e execute um código no terminal

$ gcc code.c -o code -llapack -lblas
$ ./code

Você precisa usar -lm flag para usar a biblioteca de matemática. Além disso, você pode usar -Wall para todos os avisos.

BLAS

Usar blas é bem simples.

Cabeçalho

Use cabeçalho especial junto com os outros,

#include <stdio.h>
#include <cblas.h>

Chamada de função

Basta ligar para a função

cblas_dgemv(CblasRowMajor, CblasNoTrans, 3, 3, 1.0, m, 3, x, 1, 0.0, y, 1);

Vincule e execute um código no terminal

$ gcc code_blas.c -o code_blas -lblas -lm
$ ./code_blas

Você pode ter alguns bons exemplos aqui

    
por souravc 20.01.2014 / 22:08

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