Desvantagens de executar o RAID em unidades sem correspondência:
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Você inevitavelmente terá uma unidade como a unidade mais lenta e uma unidade como a mais rápida. A unidade lenta é o gargalo, portanto, o sistema RAID inigualável será um pouco mais lento do que um sistema compatível com unidades da mesma velocidade média.
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Os tempos de falha do disco rígido provavelmente terão uma dispersão maior, fazendo com que seja provável que sua primeira falha ocorra mais cedo (pior tempo até a primeira falha) do que se você tivesse correspondido as unidades.
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Você terá, inevitavelmente, uma unidade com a maior potência elétrica. É provável que a potência total obtida pela matriz RAID inigualável atraia mais energia elétrica do que um sistema compatível com unidades com os mesmos requisitos médios de energia, aumentando o custo de alimentar o sistema e o custo de resfriamento do sistema.
Vantagens da execução do RAID em unidades incomparáveis:
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A maior vantagem das unidades incomparáveis é que os tempos de falha do disco rígido provavelmente terão uma dispersão maior. Isso dá a você mais tempo para substituir a unidade com falha e sincronizar novamente antes que a próxima falha. Se todas as unidades são tão perfeitamente combinadas que todas se desgastam e falham quase simultaneamente, então você perde todos os dados.
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Se você já tem alguns discos rígidos, muitas vezes não conseguirá encontrar exatamente o mesmo modelo de disco para completar um conjunto completo. Custa menos usar as unidades que você tem e comprar outra unidade não muito idêntica do que comprar um conjunto completo.
Desde que todas as unidades possuam a mesma capacidade de armazenamento e praticamente a mesma velocidade, acredito que, em geral, as vantagens de escolher deliberadamente unidades incomparáveis superam as vantagens de obter unidades perfeitamente compatíveis.
(Devo listar essas "vantagens para executar o RAID em unidades sem correspondência" com essa pergunta, ou há uma pergunta separada para isso?)